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DNA甲基化分析

EpiTYPER DNA 甲基化分析原理 包含四個反應步驟:Bisulfite conversion、PCR、MassCLEAVE (T7-IVT and Base-specific RNA cleavage)及Mass detection。 Bisulfite conversion 後,未甲基化之 C 將被轉換成 U,而甲基化的C鹼基將維持 C 之型態。 經 PCR 反應增幅時,所使用的 reverse primer 因帶有 T7 RNA polymerase promoter 序列,此時 T7 RNA polymerase 可利用此序列進行 in vitro transcription 合成出 RNA,並同時將序列中的 CTP 置換成為 dCTP。 RNA 產物再由 RNase A 進行 Base-specific [...]

2017-12-05T16:35:37+00:00 2017 / 10 / 13|醫療資訊|

體基因突變分析

體基因突變分析 我們使用MassARRAY進行體基因突變分析,有三種分析服務供客戶選擇。 標準型的iPLEX突變分析方法:MyCancer Panel癌症突變隨選分析,提供客制化熱點分析,可以依據您所感興趣的位點進行引子設計,可提供突變分析敏感度5-10%比例的分析結果。 高敏感度的SABER突變分析方法:分析敏感度可達0.1%比例,可以提供客製化位點分析,或是原廠已設計好的位點組合。 預先設計好的位點組合以及原廠提供的套組。 MyCancer Panel突變位點隨選分析 透過MyCancer Panel癌症突變隨選分析服務,您不再受限於現成分析組合的限制,可依據您所需要的各種型態突變:point mutation、insertion、deletion進行客製化Panel設計,提供高度彈性選擇。 SABER分析原理 SABER reaction是針對高敏度突變分析需求所開發的反應,PCR amplification 由一對專一性primer將包含Target SNP site約一百個鹼基大小的片段進行增幅反應,再由一條黏合於Target SNP site正前方的extension primer進行單一鹼基延伸反應,反應中只加入突變之使用Biotin標記之鹼基,使突變型才有可能發生專一性延伸,再進行突變產物純化。在質譜上可測得敏感度達0.1%之突變。結合超高感度與多位點分析的特色讓您能在研究上使用,如Plasma Circulating DNA樣本,滿足檢體DNA量稀少但又極需高敏感度分析的研究需求。 突變熱點分析試劑套組 包含多種肺癌突變分析相關套組,配合您肺癌臨床研究各種階段與不同目的,可以單獨聚焦熱門突變基因EGFR、KRAS、ALK Translocation或者是選擇一次數十種基因上百個位點的廣泛性的突變篩選。 提供多種肺癌分析相關套組,如:OncoFocus Panel標靶治療基因突變分析、 LungFusion ALK RET ROS1基因轉位分析、UltraSEEK Panel [...]

2017-12-05T16:40:51+00:00 2017 / 10 / 12|醫療資訊|

總基因體分析

總基因體分析 Metagenomics 針對16S rRNA變異區進行定序,可分析各類型直接採樣樣本,如臨床體液、土壤或者是食品等,可以應用在分析腸道菌相、皮膚菌相及環境土壤菌相等多種不同領域。以宏觀的角度分析菌相變化,突破傳統培養分析的盲點,也可以分析以往無法培養的菌群,隨著次世代定序技術的成熟,在目前文獻研究中已有許多重大發現,是目前微生物領域中新興的熱門研究題材。 我們的分析服務一個樣品有至少10萬筆 illumina NGS reads,進行分類學上界、門、綱、目、科、屬、種不同層級的分析,可以精確了解已知微生物的量化組成與未知微生物比例 ,且我們提供完整的分析服務流程,從取得DNA後到定序分析以及後續比對分析,您可取得一份完整的比對報告,讓您可以容易的進行總基因體學研究分析。 總基因體技術原理 總基因體分析以16S rRNA gene variable region定序方式,進行樣本的總菌相分析,先以16S rRNA 高度保留區序列引子進行總菌群的序列擴增,再將擴增產物接上adapter建置成文庫 (library),將此文庫進行次世代定序,再使用定序數據進行比對分析,使用RDP Classifier以GreenGenes資料庫進行分類,可以分類至species層級,定序讀數也可反應樣本中菌量比率。 總基因體分析服務流程與方式 實驗諮詢與樣本確認 客戶提供DNA樣本 文庫製備與定序分析 數據分析取得報告 總基因體分析檢體需求 檢體形式 : 樣本萃取DNA 檢體品質要求 : OD 260/280 ratio 1.8~2.0 檢體量需求 : [...]

2017-11-30T18:23:58+00:00 2017 / 10 / 12|醫療資訊|

標的定序分析

標的定序分析 Targeting Sequencing Targeting Sequencing技術是先篩選出特定目標基因後,再進行次世代定序分析,可以將定序資源集中在欲分析的特定區域,提供高解析度與高質量的數據。定序數據可用於發現未知突變或確認已知突變,也可提供定序筆數用於分析突變比例。此外,也可用於分析 Copy Number Variation。目標篩選適合選擇數十到數百的區域範圍進行分析。 Targeting Sequencing技術原理 依據目標基因與樣本的型態、長度,採用不同的目標篩選技術,如Probe Capture、Long range PCR、Short range PCR等方式進行目標篩選。再以Ligation或Transposome等方式建製文庫 (Library),再進行次世代定序並分析數據。 客製化標的定序分析服務 我們採用多種不同目標篩選策略,可以針對不同基因數目與要分析的標記型態,提供最佳的定序策略。並提供全客制設計分析服務,配合您感興趣的基因,設計專屬您的基因序列定序方法,提供高效率與高準確性的定序結果。針對癌症相關分析可以挑選關聯性癌症基因進行分析,以高定序深度分析微量突變,可針對不同類型研究目的進行全客製化的分析方法。 標的定序分析服務流程與方式 設計服務與實驗諮詢 客戶提供檢體給本公司進行分析 實驗分析與數據判讀後取得報告 標的定序分析檢體需求 檢體形式 : 樣本萃取DNA 檢體品質要求 : OD 260/280 ratio 1.8~2.0 [...]

2017-11-30T18:24:36+00:00 2017 / 10 / 12|醫療資訊|

NGS分析服務

NGS分析服務 採用illumina定序平台提供NGS多元定序服務,提供高質量、低錯誤率的高量定序數據。 NGS分析原理 將想要分析序列片段化,接上定序標記序列完成序列文庫,即可轉入NGS定序儀,進行分子擴增,在定序反應中進行高通量同步定序,儀器使用光學讀取每個訊號點的鹼基定序訊號,即可取得超過數百萬筆定序數據,高通量定序技術可以搭配不同的文庫建構技術,應用各種基因體研究分析如Targeting gene sequencing、RNA Sequencing、Metagenomics等多元應用。 分析服務特色 提供高通量定序數據 定序資訊可應用於未知序列變異分析 定序讀數可應用於CNV等變異分析 高彈性且高效率的多元應用目的與分析流程 客製化實驗規畫諮詢與生物資訊分析 附件下載: Service Brochure

2017-11-29T14:30:03+00:00 2017 / 10 / 12|醫療資訊|

基因型鑑定分析

iPLEX Gold SNP分型原理 此反應包含MultiPlex PCR amplification、Single nucleotide extension、Mass detection三個步驟。可用於分析含SNP、CNV、InDel等各種不同型式之序列變異性。 PCR amplification:由一對專一性primer將包含Target SNP site約一百個鹼基大小的片段進行增幅反應。 Single nucleotide extension:由一條黏合於Target SNP site正前方的extension primer進行單一鹼基延伸反應。 Mass detection:由於單一鹼基可合成出四種鹼基A、T、C、G,可利用質譜分析產物分子量,以此方法得知Target SNP site的定型結果。 iPLEX Gold SNP客製化分型優勢 本分析方式具有高通量、高效率之特性,一個well反應可設計高達40個SNP 位點,因此可大幅減低珍貴檢體的分析耗損量。由於實驗中不須採用蛋白或螢光標定之 primer,因此可提供您最高經濟效益的SNP分析方法,具有前未有的實驗彈性,不需等待原廠為您特製任何探針或偵測 primer,即可立即分析。透過 Agena 專用設計軟體 Assay Designer,可協助您完成上達數百位點的 SNP 實驗,為目前轉譯醫學研究領域 SNP 驗證重要的分析工具。 iPLEX gold 反應是在 [...]

2017-12-05T16:44:16+00:00 2017 / 09 / 25|醫療資訊|

MassARRAY分析服務

核酸質譜分析平台 MassARRAY System 全球領先、唯一將MALDI-TOF質譜原理應用於核酸分析的技術平台。其分析包含SNP分析、DNA甲基化分析、基因表達定量、序列比對等多種應用功能,並提供準確性、高效率兩大需求,是高檢體量研究計畫的最佳選擇。 MassARRAY技術原理 分析過程中DNA樣本在SpectroCHIP形成結晶,經高能雷射激發結晶,使DNA分子游離化後進入帶有電場的真空時間飛行管中,再由偵測器分析不同分子量之分析物的飛行時間,以推算出分析物分子量圖譜。 在核酸分析上能夠分析1000Da 到10000Da,可分析3~30個核苷酸的分子,配合多種不同反應設計能夠應用於多種應用分析。 MassARRAY分析平台特色與優點 質譜偵測技術提供優異靈敏度與準確率 價格便宜、不需訂購特製螢光探針 彈性且高效率的實驗設計 優異的花費效益與樣本容載率 MassARRAY分析服務流程與方式 客戶準備想分析的SNP rs number清單或是序列清單 挑選預先設計分析Panel 本公司進行Primer設計與實驗評估 客戶提供檢體、檢體清單給本公司進行分析 產出結果報告 MassARRAY分析檢體需求 檢體形式 : 96 盤裝 Genomic DNA 檢體品質要求 : OD 260/280 ratio 1.7~2.0 適用檢體 [...]

2017-11-29T14:36:58+00:00 2017 / 09 / 25|醫療資訊|