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粒線體基因定序

粒線體基因定序 Mitochondrial DNA Sequencing 粒線體是真核細胞中提供能量,產生ATP的主要胞器。關於粒線體的起源,內共生假說認為原粒線體被另一個細胞吞噬後,反而形成一種共存的關係,這也可以解釋粒線體有自己類似細菌的環狀基因組。人類的粒線體DNA (mitochondrial DNA, mtDNA) 包含16569個鹼基對,其中有37個基因及tRNA,每個細胞有100~10000個粒線體,而每一個粒線體大約有2~10組的mtDNA,因此,使用次世代定序技術 (NGS) 除了可以檢測SNPs與其他序列變異(SNV與Indel),也可以對 Heteroplasmy 進行精確定量。一般來說,mtDNA為母系遺傳,因此也被當作一種分子標記,應用於演化、法醫、系統發育等研究。 Mitochondrial DNA Sequencing 相關應用 當mtDNA產生變異、蛋白功能異常時,就會影響能量提供,對於各器官產生不同程度的病變。mtDNA的突變量通常要達到一定的量才會表現病癥,大約是高於70% mtDNA發生突變才會導致粒線體疾病。 適用領域 分子標記、演化、神經肌肉相關基因突變檢測 粒線體基因定序分析服務流程 設計服務與實驗諮詢 客戶提供檢體給本公司進行分析 樣本QC & 建庫 上機定序 數據判讀後結果討論 服務週期: 25 個工作天 粒線體基因定序分析檢體需求 [...]

2022-01-20T17:08:46+08:002021 / 01 / 13|醫療資訊|

病原體快篩試劑檢測–NG Biotech 抗藥性檢測快篩試劑

NG Biotech NG-Test CARBA 5 RUO,僅供研究使用 NG-Test CARBA 5試劑為多重免疫分析法,檢測試劑內容包括產生碳青黴烯酶的五種基因(KPC, OXA-48-like, VIM, IMP 和 NDM)快篩,適用於腸桿菌科細菌(包括大腸桿菌,肺炎克雷伯菌)和銅綠假單胞菌的抗藥性。 NG-Test CTX-M MULTI RUO,僅供研究使用 NG-Test CTX-M MULTI快篩試劑,試劑內容包含辨識CTX-M基因家族中5個主要族群CTX-M groups 1, 2, 8, 9和25,適用於可產生乙內醯氨酶(ESBLs)的抗藥性腸桿菌科細菌。 NG-Test MCR-1 RUO,僅供研究使用 NG-Test MCR-1試劑,試劑內容包括mcr-1 基因快篩。mcr-1 基因能對抗最後一線抗生素-- Polymyxin E (colistin)。 [...]

2022-01-21T08:56:35+08:002020 / 04 / 17|醫療資訊|

食品及藥廠微生物檢測-Hygiena (Dupont)

Hygiena (Dupont) 全自動PCR食品微生物檢測系統 BAX System Q7 Q7系統針對食品中的病原菌,利用基因檢測原理配合即時性PCR反應,可專一偵測特定病原菌,達到定量及定性的檢測結果。本系統在全球各大食品廠用來檢測沙門氏菌、大腸桿菌 O157:H7、李斯特菌、岅崎氏菌、空腸弧菌及大腸彎曲桿菌等危險病原菌。Q7系統偵測靈敏度可達104 CFU/mL,且靈敏度高於一般免疫測定方法100倍。Q7系統偵測的高特異性,也可降低偽陽性的檢測風險。 本系統一次上機樣本數為96個,檢測結果從樣本前處理完成後僅需90分鐘完成檢測,快速準確。結果判讀配合軟體呈現的介面,且依照微量盤格式的樣本位置,以顏色和陽性、陰性符號表示,簡單清楚。可進行大量樣本的微生物篩檢,快速、準確的檢測結果且定性定量一次搞定。 原廠網站: https://www.hygiena.com/bax-assays.html RiboPrinter System全自動核酸指紋鑑定系統 RiboPrinter 全自動微生物基因指紋鑒定系統能夠快速,準確,清晰地判別鑑定細菌,並在菌株水準上進行有效的,可重複的比對鑑定。通過功能強大的基於 DNA 的資料庫資訊,RiboPrinter 系統可在 8 小時之內自動給出任何細菌株的基因指紋譜圖。RiboPrinter 模式可鑑定和判別環境分離物,致病菌,有害生物體,質控菌株,有益生物體或任何對製藥、個人護理和食品安全工業重要的微生物。 RiboPrint技術 RiboPrint 使用 RFLP 法分析細菌基因體 rRNA 區域,依據各種細菌不同的基因序列,可由限制酶切割出不同片段大小,如同指紋般的結果,可以作為菌種鑑定的強力工具。相較傳統 16s rRNA 分析法, RiboPrint [...]

2017-12-05T16:30:58+08:002017 / 10 / 27|醫療資訊|

食品及藥廠微生物檢測-R-biopharm

R-biopharm 食品和飼料分析檢測領域的領導企業,用其倍受信賴的高品質技術雄霸全球市場 R-Biopharm 的產品領域遍及免疫學,酵素學和微生物學,適用於食品和飼料中殘留物質,成分或微生物污染狀況等方面的分析檢測。微生物學產品系列日益普及且極受關注。R-Biopharm的產品可快速,準確檢測黴菌毒素、激素、抗生素、轉基因物質、過敏原和致病菌,並成為多食品加工工廠和品管部門不可或缺的檢測工具。這些產品也同時被各國食品衛生中心和檢測單位普遍接受和使用。R-Biopharm還特別提供使用簡單方便的檢測產品,如快快速檢測試紙和檢測試片等產品。使您能成功在現場採樣進行檢測並在短時間內得到檢測報告,還可直接針對原始樣本進行檢測,不在像以往經歷樣本複雜的前處理和漫長的檢測結果的等待。我們的重點產品之一是複合型快速檢測分析試劑,實現單一產品在最短時間得到最準確的檢測結果。 Constituent 成分檢測 食品包含多種複雜的成分,R-biopharm 提供超過 180 種以上的成份分析套組,涵蓋各種碳水化合物、脂肪酸、胺基酸、維生素等。 Residues 殘留物檢測 針對食物有害殘留物或毒素分析,R-biopharm 提供的分析套組包含藻毒素 (Phycotoxins)、黴菌毒素 (Mycotoxins)、荷爾蒙 (Hormones)、抗生素 (Antibiotics)、摻假添加物 (Adulteration) 五大類, 項目齊全提供食物檢測全方位的選擇。 GMO 基因改造品檢測 針對目前日漸廣泛的基因改造作物,R-biopharm 提供SureFoodR 檢測套組,由DNA 萃取、 增殖、偵測三個步驟,包含如玉米、黃豆等經濟作物。 [...]

2017-12-11T17:27:55+08:002017 / 10 / 24|醫療資訊|

DNA甲基化分析

EpiTYPER DNA 甲基化分析原理 包含四個反應步驟:Bisulfite conversion、PCR、MassCLEAVE (T7-IVT and Base-specific RNA cleavage)及Mass detection。 Bisulfite conversion 後,未甲基化之 C 將被轉換成 U,而甲基化的C鹼基將維持 C 之型態。 經 PCR 反應增幅時,所使用的 reverse primer 因帶有 T7 RNA polymerase promoter 序列,此時 T7 RNA polymerase 可利用此序列進行 in vitro transcription 合成出 RNA,並同時將序列中的 CTP 置換成為 dCTP。 RNA 產物再由 RNase A 進行 Base-specific [...]

2021-08-05T08:51:50+08:002017 / 10 / 13|醫療資訊|

體基因突變分析

體基因突變分析 我們使用MassARRAY進行體基因突變分析,有三種分析服務供客戶選擇。 標準型的iPLEX突變分析方法:MyCancer Panel癌症突變隨選分析,提供客制化熱點分析,可以依據您所感興趣的位點進行引子設計,可提供突變分析敏感度5-10%比例的分析結果。 高敏感度的SABER突變分析方法:分析敏感度可達0.1%比例,可以提供客製化位點分析,或是原廠已設計好的位點組合。 預先設計好的位點組合以及原廠提供的套組。 MyCancer Panel突變位點隨選分析 透過MyCancer Panel癌症突變隨選分析服務,您不再受限於現成分析組合的限制,可依據您所需要的各種型態突變:point mutation、insertion、deletion進行客製化Panel設計,提供高度彈性選擇。 SABER分析原理 SABER reaction是針對高敏度突變分析需求所開發的反應,PCR amplification 由一對專一性primer將包含Target SNP site約一百個鹼基大小的片段進行增幅反應,再由一條黏合於Target SNP site正前方的extension primer進行單一鹼基延伸反應,反應中只加入突變之使用Biotin標記之鹼基,使突變型才有可能發生專一性延伸,再進行突變產物純化。在質譜上可測得敏感度達0.1%之突變。結合超高感度與多位點分析的特色讓您能在研究上使用,如Plasma Circulating DNA樣本,滿足檢體DNA量稀少但又極需高敏感度分析的研究需求。 突變熱點分析試劑套組 包含多種肺癌突變分析相關套組,配合您肺癌臨床研究各種階段與不同目的,可以單獨聚焦熱門突變基因EGFR、KRAS、ALK Translocation或者是選擇一次數十種基因上百個位點的廣泛性的突變篩選。 提供多種肺癌分析相關套組,如:OncoFocus Panel標靶治療基因突變分析、 LungFusion ALK RET ROS1基因轉位分析、UltraSEEK Panel [...]

2021-07-22T14:11:42+08:002017 / 10 / 12|醫療資訊|

總基因體分析

總基因體分析 Metagenomics 針對16S rRNA變異區進行定序,可分析各類型直接採樣樣本,如臨床體液、土壤或者是食品等,可以應用在分析腸道菌相、皮膚菌相及環境土壤菌相等多種不同領域。以宏觀的角度分析菌相變化,突破傳統培養分析的盲點,也可以分析以往無法培養的菌群,隨著次世代定序技術的成熟,在目前文獻研究中已有許多重大發現,是目前微生物領域中新興的熱門研究題材。 我們的分析服務一個樣品有至少10萬筆 illumina NGS reads,進行分類學上界、門、綱、目、科、屬、種不同層級的分析,可以精確了解已知微生物的量化組成與未知微生物比例 ,且我們提供完整的分析服務流程,從取得DNA後到定序分析以及後續比對分析,您可取得一份完整的比對報告,讓您可以容易的進行總基因體學研究分析。 總基因體技術原理 總基因體分析以16S rRNA gene variable region定序方式,進行樣本的總菌相分析,先以16S rRNA 高度保留區序列引子進行總菌群的序列擴增,再將擴增產物接上adapter建置成文庫 (library),將此文庫進行次世代定序,再使用定序數據進行比對分析,使用RDP Classifier以GreenGenes資料庫進行分類,可以分類至species層級,定序讀數也可反應樣本中菌量比率。 總基因體分析服務流程與方式 實驗諮詢與樣本確認 客戶提供DNA樣本 文庫製備與定序分析 數據分析取得報告 總基因體分析檢體需求 檢體形式 : 樣本萃取DNA 檢體品質要求 : OD 260/280 ratio 1.8~2.0 檢體量需求 : [...]

2017-11-30T18:23:58+08:002017 / 10 / 12|醫療資訊|

標的定序分析

標的定序分析 Targeting Sequencing Targeting Sequencing技術是先篩選出特定目標基因後,再進行次世代定序分析,可以將定序資源集中在欲分析的特定區域,提供高解析度與高質量的數據。定序數據可用於發現未知突變或確認已知突變,也可提供定序筆數用於分析突變比例。此外,也可用於分析 Copy Number Variation。目標篩選適合選擇數十到數百的區域範圍進行分析。 Targeting Sequencing技術原理 依據目標基因與樣本的型態、長度,採用不同的目標篩選技術,如Probe Capture、Long range PCR、Short range PCR等方式進行目標篩選。再以Ligation或Transposome等方式建製文庫 (Library),再進行次世代定序並分析數據。 客製化標的定序分析服務 我們採用多種不同目標篩選策略,可以針對不同基因數目與要分析的標記型態,提供最佳的定序策略。並提供全客制設計分析服務,配合您感興趣的基因,設計專屬您的基因序列定序方法,提供高效率與高準確性的定序結果。針對癌症相關分析可以挑選關聯性癌症基因進行分析,以高定序深度分析微量突變,可針對不同類型研究目的進行全客製化的分析方法。 標的定序分析服務流程與方式 設計服務與實驗諮詢 客戶提供檢體給本公司進行分析 實驗分析與數據判讀後取得報告 標的定序分析檢體需求 檢體形式 : 樣本萃取DNA 檢體品質要求 : OD 260/280 ratio 1.8~2.0 [...]

2017-11-30T18:24:36+08:002017 / 10 / 12|醫療資訊|

NGS分析服務

NGS分析服務 採用illumina定序平台提供NGS多元定序服務,提供高質量、低錯誤率的高量定序數據。 NGS分析原理 將想要分析序列片段化,接上定序標記序列完成序列文庫,即可轉入NGS定序儀,進行分子擴增,在定序反應中進行高通量同步定序,儀器使用光學讀取每個訊號點的鹼基定序訊號,即可取得超過數百萬筆定序數據,高通量定序技術可以搭配不同的文庫建構技術,應用各種基因體研究分析如Targeting gene sequencing、RNA Sequencing、Metagenomics等多元應用。 分析服務特色 提供高通量定序數據 定序資訊可應用於未知序列變異分析 定序讀數可應用於CNV等變異分析 高彈性且高效率的多元應用目的與分析流程 客製化實驗規畫諮詢與生物資訊分析 附件下載: Service Brochure

2017-11-29T14:30:03+08:002017 / 10 / 12|醫療資訊|
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